分享：我个人整理出来的厦大微生物笔记

　　Chap.10 传染与免疫
　　§.1 传染
　　一、传染与传染病
　　● 传染：病原突破宿主的免疫防卫系统，在宿主的特
　　定部位生长繁殖 并引起系列病理生理变化的过程。
　　● 传染病：能够从一个宿主传播到另一个宿主的疾病。
　　● 流行病：同一时间群体患病个数迅速增加的疾病。
　　二、决定传染结局的三大因素
　　一、病原体
　　1．毒力（侵袭力、毒素）
　　——侵袭力 ——吸附和侵入能力：
　　——繁殖与扩 散能力： ——对宿主防御机能的抵抗力：
　　毒素（toxin）
　　● 细菌毒素主要分外毒素和内毒素两大点
　　●外毒素与内毒素的比较： （略）●类毒素：细菌外毒素脱毒后仍保留抗原性的生物制品
　　● 测定内毒素的鲎试剂法:
　　原理：内毒素激活鲎变形细胞中的B因子引发系列的激活过程，使凝固原成为可见的凝胶状态。
　　鲎试剂检查内毒素：
　　2、侵入的病原菌数量
　　不同病原菌致病剂量差异很大
　　3、侵入门径：
　　（1）消化道（2）呼吸道（3）皮肤伤口（4）泌尿生殖道（5）其它
　　（二）、宿主的免疫力
　　● 不同个体间免疫力不同； ● 免疫：
　　●免疫功能：免疫防御；免疫稳定；免疫监视
　　（三）环境因素：良好的环境因素有助于提高机体的免疫力
　　三、传染的三种可能结局
　　1.隐性传染2.带菌状态3.显性传染
　　● 按发病部位，显传传染
　　——局部感染——全身感染
　　●全身感染（按其性质严重性）： 毒血症：菌血症：败血症：脓毒血症：
　　§2.非特异性免疫
　　●非特异性免疫：先天即有、相对稳定、对病原无特殊针对性的免疫现象。
　　●特异性免疫：后天产生，对异物（病原）具有特异性反应的免疫现象，包括体液免疫和细胞免疫。
　　● 非特异免疫组成
　　表皮和屏障结构；吞噬细胞的吞噬功能
　　正常组织和体液中的抗菌物质；炎症反应
　　一、表皮屏障结构
　　1.皮肤和粘膜
　　----机械性排阻----分泌杀菌物质 ----正常菌群
　　2．血脑屏障和血胎屏障
　　--血脑屏障：可阻挡病原菌及其毒物随血流 透入脑组织的结构；
　　--血胎屏障：由母体子宫内膜和胎儿绒毛膜共同组成。
　　二、吞噬细胞及其吞噬作用
　　人体血细胞有：红细胞、白细胞、血小板三种。
　　1.嗜中性粒细胞及其吞噬作用
　　吞噬过程：
　　1.活化：吞噬细胞受炎症因子激活；2.趋化：吞噬细胞向感染部位移动；
　　3.识别与附着：4.吞噬：利用伪足，形成吞噬体；
　　5.消化杀灭：形成吞噬溶酶体；6.排出：
　　2.巨噬细胞（Mф）及其功能
　　●功能：
　　①吞噬和杀菌作用：②抗原递呈作用：
　　MHC（主要组织相容性复合物 ）：引起组织移植排斥；帮助T细胞识别外来抗原的一种蛋白。非特异性吞噬作用
　　Mф↗
　　↘Ag- Mф （MHC） →传递给T淋巴细胞
　　③免疫调节作用：分泌IL-1、IFN、TNF等等。
　　④抗癌作用：细胞毒作用。
　　三、炎症反应
　　四、正常体液或组织中的抗菌物质
　　1、 补体：
　　-----热不稳定----酶原----作用非特异性
　　2、干扰素（IFN）：
　　●特性
　　1.化学成分：糖蛋白2.广谱抗病毒和免疫调节作用
　　3.通过干扰素诱生剂诱导产生4.作用机制：合成抗病毒蛋白，降解mRNA
　　● 干扰素的诱生和作用机制
　　● 诱生剂：活/灭活病毒；多糖；PHA(植物血凝素)等
　　● 抗病毒蛋白：AVP（antiviral protein）
　　§3特异性免疫
　　●特异性免疫（specific immunity）
　　● 特点：
　　--后天获得--有特异性--体液免疫和细胞免疫
　　--个体的差异--个体的差异
　　特异免疫力的获得方式（略）自动获得
　　一、免疫器官
　　1．中枢免疫器官：
　　①骨髓： ②胸腺：③法氏囊/类囊器官：
　　2．外周免疫器官：淋巴结、脾脏
　　二、免疫细胞及其在细胞免疫中的作用
　　（一）T细胞（T淋巴细胞）
　　1．来源
　　● T细胞又称胸腺依赖性淋巴细胞，来源于多能干细胞，随血流输送到胸腺，并在胸腺素的作用下分化，成熟。成熟的T细胞再随血液进入淋巴结，在此接受抗原刺激，成为效应T细胞，行使免疫功能。
　　● T细胞的来源和功能（略）2．T细胞主要亚群（以功能划分）
　　①调节T细胞（ TR）
　　A 辅助性T细胞(TH)：辅助B细胞，产生抗体。
　　ＴＤ抗原：胸腺依赖性抗原
　　TD-TH →释放 THＦ→促使Ｂ细胞活化，增殖转化为浆细　胞．
　　B 抑制性T细胞(T usppersor, TS)： 抑制TH，Tc和B细胞的功能。
　　②效应T细胞( TE)：
　　●迟发型超敏T细胞(TDTH )：释放淋巴因子，引起迟发型超敏反应。
　　●细胞毒T细胞( TC)：直接杀伤带TC抗原的
　　靶细胞。
　　3.T细胞表面标志：
　　●表面受体：
　　绵羊红细胞受体（E受体），E玫瑰花结试验（检测、计数T细胞）。
　　有丝分裂原受体（例：PHA，Con A等）
　　●抗原受体：1.T细胞受体(TCR)识别Ag的物质基础：●FC受体
　　（二）B淋巴细胞（骨髓依赖性淋巴细胞）
　　1．B细胞的表面受体
　　●有丝分裂原受体：●膜表面抗原受体：SmIg
　　●补体受体：● Fc受体：
　　2．B细胞的表面抗原：SmIg
　　3. B细胞的亚群和功能
　　B1--T细胞非依赖性；B2--T细胞依赖性
　　（三）其他淋巴细胞
　　1、K细胞（杀伤细胞 Killer cell）：
　　占人外周血淋巴细胞总数5～10%，能专一杀伤IgG抗体复盖的靶细胞。
　　2、NK细胞（自然杀伤细胞 natural killier cell）
　　大颗粒性淋巴细胞(large granular lymphocyte, LGL)，可直接杀伤某些肿瘤细胞或被病毒感染细胞。
　　三、免疫应答 (immune response)：
　　● 免疫应答的过程
　　1. 感应阶段：抗原识别、呈递2. 增殖分化阶段：分化为浆细胞/致敏淋巴细胞
　　3. 效应阶段：产生抗体/淋巴因子
　　免疫应答的类型和过程示意图
　　四、免疫分子及其在体液免疫中的作用
　　（一）抗原( Ag)
　　一类能诱导机体发生免疫应答，并能与相应抗体或T淋巴细胞受体发生特异性免疫反应的大分子。
　　● Ag的免疫原性、免疫反应性● 完全抗原、半抗原
　　2．免疫原性的物质基础
　　①分子量：M＞１×104Da
　　②结构复杂：抗原性强弱依次蛋白＞复杂多糖＞核酸（半抗原），类脂一般不具抗原性。
　　③异物性：异种/异体,种族关系越远，组织结构差异越大，抗原性越强。
　　3．抗原决定簇（又称：抗原表位epirope）
　　●定义:存在抗原表面决定其抗原特异性的特定化学基团。●组成：
　　●抗原结合价：抗原决定簇的总数.
　　4．细菌的抗原：
　　5.共同抗原与交叉反应
　　共同抗原（多种复杂Ag系统中共有的抗原，又称类属抗原/交叉反应性Ag）
　　(二)抗体（antibody, Ab）
　　1．定义：在Ag刺激下产生一类能够与该Ag发生反应的免疫球蛋白（Ig）。
　　Ab特征：
　　1 脊椎动物的浆细胞；②Ag刺激；③与相应Ag特异性结合；
　　④化学本质是一类具有免疫功能的球蛋白。
　　2．免疫球蛋白的基本结构
　　●链： H链，L链●区：V区，C区，铰链区
　　●类：IgG， IgA， IgM， IgD， IgE，● 亚类：
　　●型：λ和κ型●肽链的a.a数：
　　● IgG的酶解和化学分解片段
　　Fab（抗原结合片段）； Fc（可结晶片段）
　　●Ig的体和抗原结合价：
　　单体——2价；双体——分泌型IgA （4价）；五体——IgM（5价）
　　● Ig的功能区（domain）
　　抗原结合部位由VL、CL、VH、CH四个功能区组成
　　● Ig的构象变化
　　Ig分子在未与Ag结合时，呈“T”形，当Fab与Ag结合后，通过柔软的铰链区的弯曲，变成“Y”形。补体结合部位暴露。
　　4．产生抗体细胞的激活和抗体的形成
　　●相关的细胞表面标志和受体
　　----MHCII：主要组织相容性复合物II（抗原呈递）
　　-----TCR：T细胞受体（识别特异性抗原）
　　----CD4：T细胞表面抗原（识别MHCII）
　　抗体细胞的激活和抗体的形成
　　1.Mф 的抗原呈递作用；2.B细胞的激活；3.浆细胞产生抗体
　　（1）巨噬细胞：处理和传递抗原，但无特异性识别抗原的功能 。
　　（2）T细胞：在抗体形成过程起调节细胞的作用，有特异性识别抗原作用。
　　（3）B细胞：产生抗体的效应细胞，有特异识别Ag的功能。
　　5.机体产生抗体的一般规律
　　初次应答：再次应答：
　　6.抗体形成的机制
　　● Burnet的克隆选择学说 识别•记忆•自身禁忌抗体的多样性
　　7．淋巴细胞杂交瘤技术与单克隆抗体（McAb）
　　McAb:纯系B淋巴细胞克隆产生的单一成分、单一特异性 的免疫球蛋白。
　　淋巴细胞杂交瘤制备技术（略）
　　McAb的应用
　　●生物导弹●疾病的快速准确诊断
　　●高纯度药物制备●微量成分检测分析
　　§4 免疫方法及应用
　　一、抗原抗体的主要反应
　　●凝集反应：颗粒性抗原与相应抗体产生可见凝集块的反应。
　　●沉淀反应：可溶性抗原与相应抗体产生可见沉淀物的反应。
　　补体结合实验：Ag+Ab+C+E+溶血素
　　二.免疫标记技术
　　酶联免疫吸附法（ELISA）
　　●基本原理●标记物和 底物（如HRP和DAB）
　　●方法------双抗体夹心法 （测Ag）-----间接免疫吸附法（测Ab）
　　酶联免疫吸附法测定
　　Chap.10 微生物的分类和鉴定
　　●微生物分类学（microbial taxonomy）
　　●分类:在研究微生物相似性的基础上，把每一微生物编排在一定的分类单元中，制定出检索表。
　　------传统分类：形态、生化、血清-----系统分类：化石证据、RNA,DNA
　　●鉴定：运用现代分类系统，通过具体菌 株描述，给未知物一个具体的分类位置。
　　-----典型菌株（type strain）----模式种（type species）
　　●命名：按照国际命名法规，给每个新的分类群一个新的学名。------《国际植物命名法规》
　　-----《国际细菌学命名法规》
　　§.1 通用分类单元
　　（一）种的概念
　　●种：微生物的基本分类单位，具有许多共同特征的菌株的集合。
　　●亚种：Bacillus cereus subsp. mycoides●型
　　●菌株 （ Bacillus subtilis ACCC11060）
　　ATCC (美国标准菌种保藏中心）CCCMS （中国微生物菌种保藏管理委员会）
　　NIH （美国国立卫生研究所）NCTC （英国国立标准菌种收藏所）
　　二、学名的命名及有关法规
　　●双名法：Bacillus subtilis(属名+种名加词）
　　●三名法：Acetobacter pasteurianus subsp. pasteurianus
　　●名字的引用： Bacillus subtilis CMCC 63501
　　Bacillus subtilis Cohn 1874
　　Bacillus sp. Bacillus spp.
　　●缩写：Escherichia coli——E.coli
　　§.2 微生物在生物界的地位
　　● 五界系统：
　　●真核生物起源于原核细胞间的内共生-内共生学说
　　内共生学说：
　　● 共同起源，同一主先；●细菌、古生菌先于真核生物产生；
　　● 古生菌吞噬了朊细菌、兰细菌进化为真核生物。
　　● 古细菌特点： （略）
　　古生菌的假肽聚糖
　　●古生菌与细菌、真核生物膜脂结构的差别
　　CH2OH
　　HC--0--C-CH2-(CH2)13-CH3 (细菌，真核生物）
　　CH2 O
　　细菌、真核生物：甘油-酯键---脂肪酸）
　　CH2OH
　　HC-0-C-CH2-CH-(CH2)3- CH2-CH-(CH2)3 CHCH3
　　C H2 CH3 CH3 CH3
　　(古生菌：甘油-醚键-植烷基型碳水化合物)
　　§.3 各大类微生物的分类系统纲要
　　一、细菌、古生菌分类系统纲要
　　《Bergey’s Manual of Systematic Bacterialogy》1,2版
　　《Bergey’s Manual of Determinative Bacterialogy 》1~9版
　　1.古生菌：《系统手册 》（二版，2000年--）
　　原核生物 ----古生菌界（2门63属208种）----泉古生菌门---广古生菌门----细菌界
　　2.细菌的分类
　　●《系统手册 》（一版，1984~1989年，共4卷）卷 类型 群（Section） 主要代表
　　Vol. 1 G- 1~11 section 肠杆菌，假单孢菌，
　　Vol. 2 G+ 12~17 section 芽孢杆菌，梭菌，
　　Vol. 3 古生菌等 18~25 section 甲烷菌，嗜盐菌，
　　光合细菌Vol. 4 产孢放线菌 26~33 section 链霉菌
　　3.真菌（Fungi）的分类系统
　　●Ainsworth系统
　　《 The fungi 》, Ainsworth, 1973
　　《 Ainsworth and Bisby’s Dictionary of the Fungi》
　　----7版，1983年，Hawksworth----8版，1995年， Hawksworth
　　真菌界5个亚门的分类特征（略）
　　§.4 微生物分类鉴定方法
　　1、 经典分类鉴定方法（略）
　　二、现代分类鉴定方法
　　1．微生物遗传型的鉴定
　　（1）DNA碱基比例的测定 （G+C）mol%：
　　●测定方法：解链温度法（Tm值法）
　　●特点：
　　----(G+C)mol%值只能做否定判断；----（G+C）mol%值差别>5，属不同的种；
　　差别>10，属不同的属。
　　（2） 核酸分子杂交法(DNA-DNA杂交)
　　● DNA-DNA分子杂交法原理：DNA分子解链的可逆性和碱基配对的专一性。
　　DNA-DNA杂交（固相杂交法）
　　单链DNA（待测菌株）转硝酸纤维素膜——加入放射性标志参照菌DNA杂交（单链）——洗去未杂交DNA——闪烁计数器计数
　　结论：
　　1. DNA同源性≥ 60%——（同种）2. DNA同源性≥ 70%——（同亚种）
　　3. DNA同源性60~ 70%——（不同亚种）4. DNA同源性20~ 60%——（同属）
　　16s rRNA分析作为细菌进化的 计时器
　　●生物共有的●一定的信息量（1542个核苷酸）
　　●一定的保守性●便于比较研究
　　（3）16s rRNA寡核苷酸编目分析
　　待测菌株rRNA（放射标志）——RNA酶水解——双向电泳——寡核苷酸系列 （6个以上核苷酸） ——测序→求SAB
　　（4）16s rRNA核苷酸序列分析
　　● DNA-PCR法
　　提取DNA——PCR扩增16SrRNA基因——PCR产物纯化分析——16SrRNA基因序列测定
　　●相似性结果判断：
　　1. SAB≥95 %——同种2. SAB为85~95%——同属3. SAB≤85 %——不同属
　　已知序列的ｒＲＮＡ分类表（--1998.8）
　　序列 真核生物 古细菌 细菌 质体 线粒体 合计
　　LSUrRNA* 96 31 213 51 217 608
　　5ＳrRNA 1318 60 439 63 9 1889
　　SSUrRNA 3166 324 7336 120 601 11547
　　LSUrRNA:大亚基核糖体rRNA；SSUrRNA：小亚基核糖体rRNA
　　2．细胞化学组分的鉴定
　　细胞结构 成分
　　壁 肽聚糖、化学组分
　　膜 枝菌酸（棒杆菌酸；分枝菌酸）甲基萘醌
　　全细胞 水解糖类
　　1.细胞壁化学类型（分为9种类型）
　　----- 氨基酸：DAP、Gly、Lys、Asp、Orn----糖类：阿拉伯糖、半乳糖
　　● 测定方法：TLC （薄层层析法）
　　（2）全细胞水解液的糖型
　　糖类型 特征糖类
　　A 半乳糖、阿拉伯糖、
　　B 马杜拉糖
　　C 无特征糖类
　　D 木糖、阿拉伯糖
　　E 半乳糖
　　主要放线菌属的细胞壁类型和全细胞水解糖类
　　属 细胞壁化学类型 全细胞水解糖类
　　Streptomyces I（L-DAP；Gly） C（无特征糖类）
　　Micromonospora II（Meso-DAP；Gly） D（阿拉伯糖，木糖）
　　3．数值分类法
　　（1）菌株选择（OUT-操作分类单位）（2）选择实验项目
　　（3）数字编码（4）计算机分析
　　------ 相似系数的计算；
　　结果分析：
　　1. S （相似值）≥85%——（同种）
　　2. S （相似值）≥65%——（同属）
　　3. S （相似值）≤65%——（亲缘关系较远）
　　●数值分类法与传统分类法的比较 （略）

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