北京师范大学生命科学学院导师介绍:林魁
►个人简介林魁,教授、博士生导师1983年本科毕业于兰州大学数力系;1990年兰州大学理学硕士毕业(应用数学);1997年兰州大学理学博士毕业(理论生态学)
►个人简介
林魁 ,教授、博士生导师
1983年本科毕业于兰州大学数力系;1990年兰州大学理学硕士毕业(应用数学);1997年兰州大学理学博士毕业(理论生态学);1998年1月 - 1999年1月在新加坡国立大学生物信息学中心(BIC, NUS)作博士后;1999年2月 - 2000年1月在新加坡国立大学生物信息学中心(BIC, NUS)工作(Research Fellow);2000年2月 - 2001年10月在新加坡分子与细胞生物学研究所(Institute of Molecular & Cell Biology)工作(Research Fellow);2001年11月 - 2002年8月在新加坡基因组研究所(Genome Institute of Singapore)工作(Research Scientist);2002年8月-2007年6月, 北京师范大学生命科学学院副教授; 2007年7月至今北京师范大学生命科学学院教授 。
►主要研究内容
蛋白与蛋白相互作用网络的构建与分析:在全基因组水平上设计新的计算和分析方法,构建高质量的网络并同时得到高可靠性的负数据集;
植物基因组分析(黄瓜基因组):包括基因组注释、RNA-Seq转录组分析以及个体水平遗传变异分析等;
微生物基因组进化与微生物宏基因组分析:利用深度测序技术主要探讨特定条件下土壤群落微生物多样性问题。
►代表性论著
Lin, K., Zhang, D.Y. and He, F. (2009) Demographic trade-offs in a neutral model explains death rate-abundance rank relationship. Ecology, 90(1):31-38.
Guo, J., Wu, X.M., Zhang, D.Y. and Lin, K.* (2008) Genome-wide inference of protein interaction sites: lessons from the yeast high-quality negative protein–protein interaction dataset. Nucleic Acids Research, 36(6):2002-2011.
Luo, Y.Q., Fu, C., Zhang, D.Y. and Lin, K*. (2006) Overlapping genes as rare genomic markers: the γ-Proteobacteria phylogeny as a case study. Trends in Genetics 22(11): 593-596.
Wu, X.M., Zhu, L., Guo, J., Zhang,D.Y. and Lin, K*. (2006) Prediction of yeast protein-protein interaction network: insights from the Gene Ontology and annotations. Nucleic Acids Research 34(7): 2137-2150.
Lin, K*., Zhu, L. and Zhang, D.Y. (2006) An initial strategy for comparing proteins at the domain architecture level. Bioinformatics, 22(17):2081–2086.
►联系方式
电话: ************(Tel)
************(Fax)
电子邮件:linkui@bnu.edu.cn
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