浙江大学医学院导师介绍:邓宁
姓名:邓宁 性别:男 所在学院:医学院 职称:副教授
姓名:邓宁
性别:男
所在学院:医学院
职称:副教授
个人简介
2007年毕业于浙江大学生物医学工程专业,获博士学位。
自2001年起,从事生物医学仪器、蛋白质组学、转化医学信息学等相关内容的研究和实践,参与了国家自然科学基金科学仪器专项课题《双激光共焦生物芯片荧光分析仪》的研究工作,以及与日本光电公司的国际合作项目《心电诊断系统》的研发。
2007年至2010年,在美国加利福尼亚州大学洛杉矶分校(UCLA)医学院生理和医学系先后从事博士后及助理研究员工作,参与了美国国家卫生总署资助的专项重点课题《Ischemic Injury and Protection,心肌缺血损伤及保护机制》和《Cardiac Organelle Peptide Spectral Library,心脏蛋白质组谱图数据库计划》的研究,负责心脏线粒体蛋白质组及磷酸化蛋白质组的标注、定量表达分析及蛋白质组知识库构建等研究和开发。
2010年10月回国任教至今,主要从事结直肠癌转化医学信信息学、定量蛋白质组学等的研究。
工作研究领域:
蛋白质组信息学、生物信息学、转化医学信息学、生物医学知识库
发表论文:
[1] Ling Zheng, Li Wang, Da Wang, Ning Deng*, Xudong Lu, Huilong Duan, A clinical omics database integrating epidemiology, clinical, and omics data for colorectal cancer translational research. The 4th International Conference on Biomedical Engineering and Informatics. 2011 October, Shanghai. 2031-2035.
[2] Ning Deng, Jun Zhang, Chenggong Zong, Yueju Wang, Haojie Lu, Pengyuan Yang, Wenhai Wang, Glen W. Young, Yibin Wang, Paavo Korge, Christopher Lotz, Philip Doran, David A. Leim, Rolf Apweiler, James N. Weiss, Huilong Duan, Peipei Ping. Phosphoproteome Analysis Reveals Regulatory Sites in Major Pathways of Cardiac Mitochondria. Molecular & Cellular Proteomics. 2011;10(2): M110.000117:1-14.
[3] Ning Deng, Huilong Duan. Automated Microarray Image Gridding using Image Projection Vectors Coupled with Power Spectrum Model. International Journal of Pattern Recognition and Artificial Intelligence, 2010;4:581-600.
[4] Ning Deng, Yingke Xu, Deyu Sun, Panfang Hua, Xiaoxiang Zheng, Huilong Duan. Image Processing for Fusion Identification between the GLUT4 Storage Vesicles and the Plasma Membrane. Journal of Signal Processing System. 2009;1-3:115-125.
[5] Haojie Lu, Chenggong Zong, Yueju Wang , Glen W. Young, Ning Deng, Pete Souda, Xiaohai Li, Julian Whitelegge, Oliver Drews, Pengyuan Yang, Peipei Ping. Revealing the Dynamics of 20S Proteasome Phosphoproteome: A Combined CID and ETD Approach. Molecular & Cellular Proteomics. 2008;7:2073-2089.
[6] Chenggong Zong, Yueju Wang, Haojie Lu, Glen W. Young, Ning Deng, Oliver Drews, Peipei Ping. Two Dimensional Electrophoresis-Based Characterization of Post-Translational Modifications of Mammalian 20S Proteasome Complexes. Proteomics. 2008 ;8:5025-5037.
[7] Jun Zhang, David A. Liem, Michael Mueller, Yueju Wang, Chenggong Zong, Ning Deng, Thomas M. Vondriska, Paavo Korge, Oliver Drews, W. Robb Maclellan, Henry Honda, James N. Weiss, Rolf Apweiler, Peipei Ping. Altered Proteome Biology of Cardiac Mitochondria Under Stress Conditions. Journal of Proteome Research. 2008;7:2204-2214.
[8] Jun Zhang, Xiaohai Li, Michael Mueller, Yueju Wang, Chenggong Zong, Ning Deng, Thomas M. Vondriska, David A. Liem, Jeong-In Yang, Paavo Korge, Henry Honda, James N. Weiss, Rolf Apweiler, Peipei Ping. Systematic characterization of the murine mitochondrial proteome using functionally validated cardiac mitochondria. Proteomics. 2008;8(8):1564-1575.
[9] Huilong Duan, Ning Deng. A Survey on Image-based Microarray Analysis. Chinese Journal of Biomedical Engineering. 2006;25:780-785.
[10] Christopher Lotz, Ning Deng, Jun Zhang, Yueju Wang, Chenggong Zong, David A. Liem, Christine Wu, James N. Weiss, John Yates, Rolf Apweiler, Peipei Ping. Remodeling of the Mitochondrial Electron Transport Chain in a Genetic Model of Cardioprotection. AHA Basic Cardiovascular Sciences. 2010, July, Palm Springs, USA.
[11] Xudong Lu, Huilong Duan, Zhengxing Huang, Ning Deng. The Design of Formatted Report Language and its Applications in Medical Information Systems. IEEE Proc. of Engineering in Medicine and Biology Society. 2005: 554-557.
大会报告:
[1] 邀请报告.首届全国计算蛋白质组学研讨会. 中国北京. 2010年11月.
[2] 邀请报告.第三届中日韩系统生物学研讨会.中国苏州.2011年11月.
获奖情况:
[1] 2009年国际人类蛋白质组组织青年学者奖(HUPO Young Investigator Awards)
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