中科院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室介绍
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遗传资源与进化国家重点实验室的前身为依托于中国科学院昆明动物研究所的中科院部门重点实验室“
遗传资源与进化国家重点实验室的前身为依托于中国科学院昆明动物研究所的中科院部门重点实验室“细胞与分子进化重点实验室”。2007年11月经科技部批准筹建,2009年9月通过验收。目前实验室主任为张亚平院士,学术委员会主任为朱作言院士。
实验室立足于我国西南和东南亚丰富的生物多样性遗传资源,面向战略生物资源的国家需求和世界科技前沿,布局了遗传资源多样性的演化与保护、基因与基因组的进化、遗传发育与进化三个重点研究方向。
1、遗传资源多样性的演化与保护:进一步收集遗传资源,特别是我国西南地区丰富的少数民族和动物的遗传资源,研究遗传资源(多样性) 的形成和演变的规律,尤其是珍稀物种的濒危机制及其保护策略、野生和家养动物遗传资源的多样性和驯化演变关系,为遗传资源的保护和合理利用提供科学依据;
2、基因与基因组的进化:以不同关键进化地位的生物类群为研究对象,研究基因起源和进化的规律、基因适应性进化对环境适应的意义、基因功能途径和网络的进化模式、基因家族结构与功能演变的基础及其进化的模式和机制、基因组的起源与进化,探讨基因、基因家族和基因组的结构、功能在生物进化过程中的形成机制和进化规律;
3、遗传发育与进化:通过对近缘物种和不同进化地位的代表类群(如昆虫、头索动物、两栖类和哺乳类等) 发育调控机制的比较研究,在不同进化水平分析物种演化的发育生物学机制,如新基因、新的基因表达调控机制对物种形态演化与适应性的贡献。
2006-2010年间,实验室共承担国家、省(部门)科研项目181项,其中,973项目主持2项,参与4项;国家科技重大专项3项,国家科技支撑计划2项;国家自然科学基金创新研究群体项目1项,杰出青年科学基金3项,重大研究计划项目2项,重点项目8项;国际重大合作项目3项;中科院创新工程重大项目9项。
实验室承担了国家重大科学工程“中国西南野生生物种质资源库”动物分库的建设,在生物多样性资源收集方面取得了重大进展,在此基础上,实验室牵头组织我国生命条形码计划,使我国成为“iBOL国际重大计划”的四个中心节点之一,还牵头组织了“国际山羊基因组计划”、作为主要成员参与组织“国际绵羊基因组计划”等重大国际项目,产生了重要国际影响。五年来,实验室将资源优势与科学前沿有机结合,围绕遗传资源多样性的演变规律、自然/人工选择与生物适应的遗传机制等关键科学问题,在生物多样性演化的格局、过程与机制方面形成了一批具有国际影响的代表性成果,共发表SCI论文318篇,其中在Nature,Science,Nat. Biotechnol.,PNAS等国际顶级学术期刊上发表论文34篇,包括第一作者(含共同第一作者)或通讯作者(含共同通讯作者)论文20篇。论文的平均影响因子4.3/篇,平均引用次数5.3次/篇,单篇最高引用次数116次。另外,实验室在濒危物种的遗传种质资源的保护、恢复和可持续利用方面也有重大突破,受到了Nature,Science,Nat. Rev. Genet.等杂志的专题评述。实验室还参与编写专著7本,申请专利4项。五年来,实验室共获国家自然科学奖二等奖2项,省部级自然科学奖一等奖3项,二等奖、三等奖各1项,云南省科技成果奖(技术发明类)三等奖1项。
目前实验室拥有研究组14个,支撑部门3个,固定研究人员91人,是一支由中青年为主(平均年龄35岁)组成的高素质研究队伍。14位学科组长(PI)中,中国科学院院士1人、国家杰出青年科学基金获得者4人,百千万人才工程国家级人选3人,百人计划人才7人,中国科学院和德国马普学会青年科学家小组组长2人,云南省高端科技人才2人。长江学者成就奖一等奖1人,何梁何利基金科学与技术进步奖获得者1人,中国科学院王宽诚西部学者杰出贡献奖1人,云南省自然科学突出贡献奖1人。另外拥有副研究员10人,40岁以下具博士学位年轻研究人员20余人。实验室还拥有硕士点4个、博士点3个,博士后工作站1个,在学研究生、博士后共100多名。五年来,1人获全国百篇优秀博士学位论文,2人获中国科学院优秀博士学位论文,1人荣获中国科学院院长奖学金特别奖。
实验室目前拥有进行细胞和分子进化研究的各种大小仪器设备200余台,包括基因芯片扫描仪Affymetrix GC3000、基因分型系统Beckman GENOTYPING System、倒置荧光显微镜Leica DMI6000B、双向电泳GE /Ettan DIGE System、高性能计算机组曙光4000A、DNA序列分析仪ABI 3130xl、Roche454测序仪等大型仪器。以此为基础,建立了高通量的DNA测序平台、生物信息学大型计算机分析平台、基因功能分析平台、蛋白质组学分析平台、高通量的基因型分析平台等5大平台。以满足实验室在后基因组时代对基因组进化与基因功能研究的需求。这些平台同时对社会开放使用。另外,实验室还拥有无量山黑长臂猿监测站、哀牢山国家级自然保护区野生动物研究基地双柏监测站等野外观察站4个,云南土著鱼类养殖基地3个。为实验室的创新发展提供了重要支撑。
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