中科院昆明动物研究所导师介绍:周巨民
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姓名: 周巨民 性别: 男
姓名: | 周巨民 | 性别: | 男 |
职称: | 研究员 | 学历: | 博士 |
电话: | +86 871 65137652 | 传真: | +86 871 65137652 |
电子邮件: | zhoujm@mail.kiz.ac.cn zhouj@wistar.org | 个人主页: | |
通讯地址: | 云南省昆明市教场东路32号 中国科学院昆明动物研究所 650223 |
职务:
表观遗传和基因调控实验室负者人
简历:
研究员、博士生导师,基因调控和表观遗传学科组负责人。2011年中科院“百人计划”引进人才。反绝缘子的发现者,已在Cell,Genes Dev.,PNAS,Molecular Cell,MCB,Development 等杂志发表多篇具有广泛影响的学术论文,文章被引用超过1000次。并应邀为Molecular Cell,Developmental Cell,MCB,PNAS,Development 等杂志审稿。
1982.9-1986.7,复旦大学生物系,学士学位
1986.9-1989.6,中国科学院上海药物研究所。
1990.9-1995.6,美国德克萨斯大学医学博士MD安德森癌症研究中心(University of Texas MD.Anderson Cancer)生物化学专业博士(导师:Dr.Eric Olson)。
1995.7-2000.8,美国加州大学伯克利分校的分子生物系(University of California at Berkeley,Department of Molecular Cell Biology)博士后(导师:Dr.Mike Levine)。
2000.9-2007.12,美国宾夕法尼亚大学 威斯达研究所(Wistar Institute)基因表达与调控系 助理教授。
2008.1-现在,美国宾夕法尼亚大学 威斯达研究所(Wistar Institute)基因表达与调控系 副教授。
2003-现在,美国宾夕法尼亚大学 医学院遗传学系(University of Pennsylvania School of Medicine Genetics Department) 兼职教授。
2003-现在,美国宾夕法尼亚大学 细胞分子生物学研究生部导师(University of Pennsylvania Cell and Molecular Biology Graduate Group,faculty member)。
2011.3-现在 中国科学院昆明动物所研究员。
研究方向:
遗传学、基因组学和染色质生物学的发展已将我们对表观基因组学的认识带入了一个探索受高度调控的、复杂而有序染色质三维结构的全新时代。正是这个错综复杂的表观基因组学,为我们揭示人类发育和疾病的奥秘提供了契机。我们生存的环境与个体的发育和疾病的产生具有密切关系。外界环境可以通过组蛋白和直接对DNA的修饰而影响细胞的功能,最终导致基因表达的变化。
我们都知道,要激活一个基因,启动子和增强子是必不可少的,但是在表观基因组学水平上,需要有更多的调控元件参与到这个过程中,比如绝缘子,它是将基因组划分为活跃区域和非活跃区域的DNA元件。再如远程调控元件,它能够使增强子跨过很长的距离来激活特定的启动子,其中一种被称为反绝缘子,它能够使增强子跨过位于增强子和启动子之间的绝缘子而发挥调控作用。重要的是我们发现的反绝缘子的作用方式具有隔代表观遗传的特征。这为研究非孟德尔遗传的机制提供了一个极好机会。我们在一个控制果蝇发育的重要的基因复合体(Hox基因复合体)中发现了这两种调控元件。我们的首要目标就是揭示这些表观遗传学元件的作用机制。
CTCF是一种通过绝缘子来起作用的关键蛋白,它也是组织染色质高级结构的核心蛋白,而且它的功能从果蝇到人类,包括一些人类的病原体,如EBV、KSHV、HSV等都是很保守的。我们的主要兴趣是揭示这个绝缘子结合蛋白及其他染色质组成成分在这些病毒侵染过程中的表观遗传学机制。在研究单纯疱疹病毒(HSV)的同时,我们也用这一模式病毒为工具来探索细胞染色质高级结构对外界病原入侵的反应规律。
承担科研项目:
项目类别 | 名 称 | 研究起止年月 | 资助金额(万元) | 职责 | 执行情况 |
中国科学院项目“百人计划” | 利用树鼩模型研究绝缘子及染色质在单纯疱疹病毒潜伏期中的调节作用 | 2011.06-2014.06 | ¥200 | 主持 | 正在进行 |
中国科学院昆明动物研究所及动物模型与人类疾病机理重点实验室 | 基因调控与表观遗传学科组启动资金 | 2011.03-2013.03 | ¥250 | 主持 | 正在进行 |
美国国立卫生研究院 PO1 (NS 33768) | The mechanism of the latency of the Herpes Simplex Virus | 2007-2012 | $130.4364 | 正在进行 | |
出生缺陷基金会 | Identification and characterization of the proteins interacting with the PTS element | 2009-2012 | $25.8418 | 主持 | 正在进行 |
美国国立卫生研究院 R01 GM 65391-01A1 | Dissecting the Functions of a Novel Cis-Element PTS | 2003.04-2008.04 | $151.9344 | 主持 | 已结题 |
出生缺陷基金会 | Facilitating Long Range Enhancer-Promoter Interactions by the PTS Element | 2003.06-2006.05 | $19.1400 | 主持 | 已结题 |
爱德华·马林克罗特JR.基金会 | Regulating Enhancer-Promoter Communications in the Hox Gene Cluster by the PTS Element | 2004.10-2005.09 | $10.0000 | 主持 | 已结题 |
关心基金会 | Regulating Enhancer-Promoter Interactions by a Novel Cis Element,PTS | 2002.07-2004.06 | $22.0000 | 主持 | 已结题 |
W.W.Smith 慈善责任机构 | Regulation of long Range gene activation by the Promoter Targeting Sequence | 2002.09-2003.08 | $8.0000 | 主持 | 已结题 |
美国国立卫生研究院,国家癌症研究所,Cancer Center New Investigator Award | Study specialized regulatory DNA element in development | 2001-2005 | $25.0000 | 已结题 | |
联邦全球研究强化项目 | Pennsylvania Department of health | 2001-present | $20.0000 | 正在进行 | |
白血病研究基金会 | Regulating Enhancer-Promoter Interactions by a Novel Cis Element,PTS | 2001.07-2002.06 | $7.5000 | 主持 | 已结题 |
在美国总研究经费约415万美元(Total Cost) |
专家类别:
研究员,百人计划
代表论著:
1.Lin Q.,Lin L.,and Zhou,J.(2010).Chromatin Insulator and the Promoter Targeting Sequence modulate the timing of long-range enhancer-promoter interactions in the Drosophila embryo.Developmental Biology 15;339(2):329-337.
2.Smith S.,Wickramasinghe P.,Olson A.,LouKinov D.,Lin L.,Deng J.,Xiong Y.,Rux J.,Sachidanandam R.,Sun H.,Lobanenkov V.,and Zhou,J.(2009).Genome wide ChIP-chip analyses of dCTCF reveal important roles for insulator proteins in Drosophila genome organization.Developmental Biology 15;328(2):518-28.
3.Chen Q.,Lin L.,Huang J.,Smith S.,Planck J.,Berger S.,and Zhou,J.(2007) A CTCF dependent boundary exists in the LAT HSV-1 genome to separate latent and lytic specific genes.J.Virology 81(10):5192-201.
4.Lin Q.,Chen Q.,Lin L.,Smith S.,and Zhou,J.(2007).The Promoter Targeting Sequence mediates enhancer interference in the Drosophila embryos.PNAS 104:3237-3242.
5.Chen,Q.,Lin,L.,Smith,S.,Lin,Q.and Zhou,J.(2005).Multiple Promoter Targeting Sequences exist in Abdominal-B to regulate long-range gene activation.Developmental Biology 286,629-36.
6.Moon,H.,Filippova,G.,Loukinov,D.,Pugacheva,E.,Chen,Q.,Smith,S.T.,Munhall,A.,Grewe,B.,Bartkuhn,M.,Arnold,R.Ohlsson R,Zhou,J,Renkawitz R,Lobanenkov V.(2005).CTCF is conserved from Drosophila to humans and confers enhancer blocking of the Fab-8 insulator.EMBO Rep 6,165-70.
7.Zhou,J.and Berger,S.L.(2004).Good fences make good neighbors:barrier elements and genomic regulation.Molecular Cell 16,500-2.
8.Lin,Q.,Chen,Q.,Lin,L.and Zhou,J.(2004).The Promoter Targeting Sequence mediates epigenetically heritable transcription memory.Genes Dev 18,2639-51.
9.Lin,Q.,Wu,D.and Zhou,J.(2003).The promoter targeting sequence facilitates and restricts a distant enhancer to a single promoter in the Drosophila embryo.Development 130,519-26.
10.Zhou,J.,and Levine,M.(1999).A novel cis-regulatory element,the PTS,mediates an anti-insulator activity in the Drosophila embryo.Cell 99,567-575.
11.Zhou,J.,Ashe,H.,Burks,C.,and Levine,M.(1999).Characterization of the transvection mediating region of the Abdominal-B locus in Drosophila.Development 126,3057-3065.
12.Zhou,J.,Zwicker,J.,Szymanski,P.,Levine,M.,and Tjian,R.(1998).TAFII mutations disrupt Dorsal activation in the Drosophila embryo.PNAS 95,13483-13488.
13.Zhou,J.,Cai,H.N.,Ohtsuki,S,and Levine,M.(1997).The regulation of enhancer-promoter interactions in the Drosophila embryo.Cold Spring Harbor Symp.Quant.Biol.LXII:307.
14.Zhou,J.,Barolo,S.,Szymansky,P.and Levine,M.(1996).The Fab-7 element of the bithorax complex attenuates enhancer-promoter interactions in the Drosophila embryo.Genes Dev.10:3195-3201.
15.Staudinger,J.,Zhou,J.,Burgess,R.,Elledge,S.J.and Olson,E.N.(1995).PICK1:a perinuclear binding protein and substrate for protein kinase C isolated by the yeast two-hybrid system.J.Cell Biol.128,263-71.
16.Zhou,J.and Olson,E.N.Dimerization through the Helix-loop-helix motif enhances phosphorylation of the transcription activation domains of myogenin.(1994).Mol.Cell.Biol.14,6232-6243.
17.Li,L.,Zhou,J.,James,G.,Heller-Harrison,R.,Czech,M.and Olson,E.N.(1992).FGF inactivates myogenic helix-loop-helix proteins through phosphorylation of a conserved protein kinase C site in their DNA binding domains.Cell.71,1181-1194.
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