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一、国家一级学会期刊/EI/ISTP/ISSHP检索期刊/核心期刊论文：
1. 马占新．基于偏序集理论的数据包络分析方法研究．系统工程理论与实践, 2003, 23 (4) :11~17 （中国系统工程学会会刊， EI检索：2003307568706）
2. 马占新．样本数据包络面的研究与应用．系统工程理论与实践, 2003, 23(12): 32~37 （中国系统工程学会会刊， EI检索：2004078021017）
3. 马占新，任慧龙，戴仰山．DEA方法在多风险事件综合评价中的应用研究．系统工程与电子技术, 2001,23(8):7~11 （中国系统工程学会期刊， EI检索：2001426691487）
4. 马占新．数据包络分析方法的研究进展．系统工程与电子技术，2002, 24(3):42~46 （中国系统工程学会期刊， EI检索：2002397116544）
5. 马占新．关于树形图结构的智能化研究．系统工程与电子技术, 2004, 26(1):44~47 （中国系统工程学会期刊， EI检索：2004118060858）
6. 马占新．综合数据包络分析模型及其软件系统设计．系统工程与电子技术, 2004,26(12):1917~1922 （中国系统工程学会期刊， EI检索：2005068830207）
7. 马占新，张海娟．用于组合有效性综合评价的非参数方法研究．系统工程与电子技术, 2006, 28(5): 699-703,787 （中国系统工程学会期刊， EI检索：2006259949943）
8. 马占新，吕喜明．带有偏好锥的样本数据包络分析方法研究．系统工程与电子技术, 2007, 29(8):1275-1282 （中国系统工程学会期刊， EI检索：20074110859218）
9. 马占新，马生昀．基于C2W模型的样本数据包络分析方法研究．系统工程与电子技术，2009, 31(2)：366-372 （中国系统工程学会期刊， EI检索：20091311991374）
10. 马占新．竞争环境与组合效率综合评价的非参数方法研究．控制与决策，2008, 23 (4):420-424，430 （国家自然科学基金委管理学A类重要刊物， EI检索：20082211286171）
11. Ma Zhan-xin, Zhang Hai-juan, Cui Xiao-hong. Study on the Combination Efficiency of Industrial Enterprises[C]. Proceedings of International Conference on management of Technology, Australia: Aussino Academic Publishing House, 2007: 225 ~230 (EI检索：20084511688766, ISTP检索,ISSHP检索：000252215000039)
12. 包斯琴高娃，马占新，杨体强．电场对作物种子影响有效性的综合评价方法．农业工程学报，2008，24(3)：25-30 （中国农业工程学会会刊， EI检索：20081911245162）
13. Ma Zhan-xin, Liu Rong. A Method for Evaluating Sustainable Development of Regional Economic. Proceedings of 2008 Conference on Regional Economy and Sustainable Development, Australia: M&D Forum, 2008: 1180~1186 (ISTP检索： )
14. Lv ximing, Ma Zhan-xin. Study of Efficiency Evaluation of Commercial Banks by Using Sample DEA Method. Proceedings of International Conference on management of Technology, Australia: Aussino Academic Publishing House, 2008: 541 ~546 (ISSHP检索：000260117400095)
15. 马占新，任慧龙．一种基于样本的综合评价方法及其在FSA中的应用研究．系统工程理论与实践, 2003, 23(2):95~101 （国家自然科学基金委管理学A类重要刊物，中国系统工程学会会刊）
16. 马占新，唐焕文．关于DEA有效性在数据变换下的不变性．系统工程学报1999, 14(2):40~45 （国家自然科学基金委管理学A类重要刊物，中国系统工程学会会刊）
17. 马占新，唐焕文．一个综合的DEA模型及其相关性质．系统工程学报,1999, 14(4):311~316 （国家自然科学基金委管理学A类重要刊物，中国系统工程学会会刊）
18. 马占新，唐焕文，戴仰山．偏序集理论在数据包络分析中的应用研究．系统工程学报, 2002, 17(1):19~25 （国家自然科学基金委管理学A类重要刊物，中国系统工程学会会刊）
19. 马占新．偏序集理论在DEA相关理论中的应用研究．系统工程学报，2002, 17(3): 193~198 （国家自然科学基金委管理学A类重要刊物，中国系统工程学会会刊）
20. 马占新，唐焕文．降低风险措施有效性综合评价的一种非参数方法．运筹学学报, 2005, 9(3):89~96 （国家自然科学基金委管理学A类重要刊物，中国运筹学会会刊）
21. 马占新，唐焕文．宏观经济发展状况综合评价系统研究．系统工程，2002, 20(2):30~34 （国家自然科学基金委管理学A类重要刊物）
22. 马占新，任慧龙．船舶综合安全评估中的评价方法研究．系统工程与电子技术, 2002, 24(10): 66~69 （中国系统工程学会期刊，《Science Abstract》检索, EI检索期刊）
23. 马占新．一种用于区域公路交通网络综合评价的方法研究．数学的认识与实践, 2005, 35(5):23~32 （中国数学学会会刊）
24. 马占新．关于弱DEA有效性的本质特征．数学的认识与实践, 2005, 35(9):140~148 （中国数学学会会刊）
25. 马占新．数据包络分析方法在中国经济管理中的应用研究．管理学报，2009，（国家自然科学基金委管理学B类重要刊物，）
26. 马占新，刘荣．一种用于区域经济业绩评价的非参数方法．工业技术经济，2009, (4): 118-123 （中国区域经济学会期刊，全国中文核心期刊）
27. 马占新，唐焕文．DEA有效单元的特征及SEA方法．大连理工大学学报,1999, 39( 4):577~582 （EI检索期刊、全国中文核心期刊）
28. Ma Zhan-xin. On a characterization theorem of semi-modular lattices. Northeastern Mathematical Journal, 1999,15(4):382~384 （美国数学会《Mathematical Reviews》检索：MR1757120）
29. 马占新，赵萃魁．关于格的子格格中所含五边形个数的估计式．数学杂志，2002,22(4):459~463 （美国数学会《Mathematical Reviews》检索：MR1926590）
30. 马占新，任慧龙，戴仰山．模糊综合评判方法的进一步分析．模糊系统与数学,2001,15(3):61~68 （美国数学会《Mathematical Reviews》检索：MR1854679）
31. 马占新．关于格的子格格长度．内蒙古大学学报，1996, 27(3): 597~600 （美国数学会《Mathematical Reviews》检索：MR1445214）
32. 马占新，周林平．高等学校科研论文定量评估机制研究．科技管理研究，2006, 26(10):139~143 （全国中文核心期刊，CSSCI检索）
33. Ma Zhan-xin, Zhou Dong-sheng, Tang Huan-wen. Research on the Method for Evaluating the Combination Efficiency of Energy Enterprises[C]. Proceedings of ’99 International Conference on Improving Management through University Industry Partnership, Dalian: Dalian University of Technology Press, 1999:559~565.
34. 马占新，刘荣．一种用于区域经济效益评价的非参数方法．统计与决策，2009-5-1 （全国中文核心期刊）
35. 马占新．一种基于样本前沿面的综合评价方法．内蒙古大学学报，2002, 33(6):606~610 （全国中文核心期刊）
36. 马占新．经济社会整体发展水平综合评价的DEA方法．内蒙古大学学报，2002, 33(5) :499~503 （全国中文核心期刊）
37. 马占新，张海娟．关于子格格的若干性质．内蒙古大学学报，2004, 35(3): 241~245 （全国中文核心期刊）
38. 马占新．一个判断决策单元有效性的算法．内蒙古大学学报，2009，40(1):1-6 （全国中文核心期刊）
39. 马占新．DEA模型的工程效率含义研究．内蒙古大学学报，2009, 40(4): （全国中文核心期刊）
40. 马占新，唐焕文．评价相对有效性的一种新的模型和方法．华中师范大学学报，1998(专辑) :94~97 （全国中文核心期刊）
41. 孙娜，马占新．样本评价DEA模型的灵敏度分析．数学的实践与认识，2009， （中国数学学会会刊）
42. 王 丽，马占新．拓展的基于样本的综合评价模型及其性质．系统工程，2006, 24(2):118-122 （国家自然科学基金委管理学A类重要刊物）
43. 朱光羲, 马占新．基于DEA的企业可持续发展评价研究．中国管理科学，2008, 16(专辑): 358~361 （国家自然科学基金委管理学A类重要刊物）
44. 贾晶莹，马占新．煤电联营企业机组运行效率分析与实证研究．煤炭经济研究， (中国煤炭经济研究会)
45. 郭伟斌，唐焕文，马占新．神经网络预测系统中的输入输出指标研究．大连理工大学学报,1999, 39(4):583~587 （EI检索期刊、全国中文核心期刊）
46. 吕喜明，马占新．基于AHP的样本数据包络分析模型．内蒙古大学学报，2008，39(11):614-619 （美国数学会《Mathematical Reviews》检索：MR2468856）
47. 伊茹，马占新．内蒙古城市土地经济效益的投入产出效率研究．统计与决策，2009, (1):99-101 （全国中文核心期刊）
48. 贾晶莹，马占新．煤电联营企业经济状况效率分析．统计与决策，2009-5 （全国中文核心期刊）
49. 木仁，马占新，张昆龙．有1模格的等价定义．内蒙古大学学报，2009，40( ): - （全国中文核心期刊）
50. 王宇，周林平，马占新，王志平．内蒙古地区高校科技创新团队研究探析．现代大学教育（增刊），2007:127-130 （全国中文核心期刊）非核心期刊
51. 姚大强，马占新．数据包络分析方法在物流评价中的研究进展．中国储运，2007(8):119-120
52. 王宇，云国宏，马占新等．高校科研信息管理系统的开发与应用．第三届中美电子商务高级论坛，天津，2006．
53. 图雅，马占英，马占新．基于DEA方法的高校人力资源测评方法研究．内蒙古师范大学学报，2007, 20 (11 ):16-19
54. 马占英，邢 俊，马占新．运用系统科学思想全面提升农村经济结构优化水平．前沿，2005, (2): 66~70
55. 马占英，王 丽，马占新．坚持科学发展观 努力加强农村人力资源开发．前沿，2005, (4): 18~21
56. 刘荣，马占新．DEA方法在宏观经济发展综合评价中的研究进展．北方经济，2008, (6): 20-22
57. 贾晶莹，马占新．煤电联营综述．北方经济，2009, 3
58. 马占新，温秀晶，马占英．浅析乡镇村级电子政务工作网络的建设与设计．内蒙古科技与经济，2008，（24）：70-72
59. 王 丽，马占新，马占英．内蒙古自治区宏观经济发展状况综合评价研究．内蒙古科技与经济，2005, (24): 4-8
60. 姚大强，马占新．城市生活垃圾物流系统的收集路径优化．内蒙古科技与经济，2008，(4)：66-68
61. 朱光羲，马占新．基于DEA的上市公司绩效评价．内蒙古科技与经济，2008，(21): 18-19，52
62. 贾晶莹，马占新．基于DEA方法的内蒙古区域经济效益分析的实证研究．内蒙古科技与经济，2009, (1): 2-4, 38.
63. 包斯琴高娃，马占新，敖敦格日乐．高压电场处理作物种子技术及其应用研究．内蒙古科技与经济，2009,(3): 107-108
64. 李萍萍，马占新．山东省城市商业银行效率评价及实证分析. 科技市场经济，2009-4-18
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