福州大学生物科学与工程学院导师介绍：吕暾

　　姓名：吕暾　　
　　性别：男　　
　　职称：研究员　
　　学院：生物科学与工程学院
　　电子邮件: lvtun@yahoo.com
　　电话: ***********
　　　

　　个人简历：

　　所受教育
　　物理化学博士 (20002-2007)
　　韦恩州立大学(美国)　　化学系　　　　　计算机工程硕士 (2001-2002)
　　韦恩州立大学(美国)　　计算机工程系　　生物化学硕士 (1996-1999)
　　清华大学　　　　　　　生物系　　　　　生物化学学士 (1991-1996)
　　厦门大学 　　　　　　生物系

　　工作经历
　　2008-目前　　福州大学生物科学与工程学院 研究员
　　从事功能蛋白工程的研究，目前关注抗体，疫苗，工业用酶

　　2007-2007　　美国韦恩州立大学医学院 助理研究员
　　研究Melatonin对嗜酸性蛋白过氧化物酶EPO的抑制作用和EPO抑制药物的初步筛选和设计

　　2002-2007　　美国韦恩州立大学化学系 助理研究员
　　计算化学并行程序的开发

　　2001-2002　　美国密歇根大学技术学院 讲师
　　Bioinformatics Certificates 资格考试培训

　　参与的课题
　　束缚环境下的化学反应机理

　　高性能并行计算集群系统的分布式文件系统开发

　　HIV 蛋白酶点突变与HIV多重抗药性相关性研究

　　基于距离几何的水稻金属硫蛋白三维结构预测方法
 

　　个人简介：
　　1.技术平台：
　　1.1 生物大分子模拟：运用分子动力学模拟软件，对蛋白质、核酸等生物大分子的性质进行研究，探索结构与功能的关系。
　　1.2 计算机辅助蛋白质设计：对蛋白质的氨基酸序列进行设计以提高目标蛋白的性能，例如抗体的亲和力，蛋白的热稳定性。
　　1.3 分子筛选与定向进化系统：主要是噬菌体展示系统，目前利用它来筛选抗体，展示抗原表位。
　　2. 研究领域:
　　2.1 围绕单个生物大分子的结构与功能展开工作，通过分子的理性设计对药物蛋白进行改造、修饰，改善药物蛋白的性能，如高效药物蛋白的理性设计，药物蛋白稳定性的提高，筛选、设计新型酶, 功能多肽的设计等。3.2
　　2.2 围绕生物大分子间最基本的相互作用“分子结合”展开工作，如通过研究抗原-抗体结合开展抗体药物筛选，病毒中和抗体的筛选，病毒检测试剂盒的研发，疫苗的设计等应用研究。
　　2.3 生物大分子相互作用系统上，关注蛋白质表达系统，基因表达调控网络，肝硬化，衰老分子生物学。

　　 承担科研项目：

　　(1) 2008-2011 校科研启动基金：抗三聚氰胺单克隆抗体的筛选，犬细小病毒二代疫苗开发，抗体亲和力成熟系统构建。

　　(2）2008-2011年主持福建省青年人才创新基金：基于网络服务模式和GPGPU的生物分子模拟软件”（项目编号2008F306010107）

　　(3）2007-2008年参与美国NIH基金项目：“Melatonin对嗜酸性蛋白过氧化物酶的作用机理及其抑制药物的初步筛选和设计”（项目编号R01 HL066367）。

　　(4）2001-2004年参与美国能源部基金项目: “纳米尺度下的化学反应动力学”（项目编号 DE-FG02-01ER15212）。

　　(5）2003-2005协助完成国家自然科学基金：“水稻茎部高效表达金属硫蛋白基因启动子的鉴定”（项目编号30270753）。

　　(6）1999-2003协助完成国家重点基础研究专项基金:“光合作用高效光能转化的机理”（项目编号G1998010100)。

　　教授课程： 生物信息学，计算生物学，系统生物学，仪器分析

　　论文发表

　　1. Isolation and identification of a ScFv Antibody against Melamine from a Rabbit Phage Display Library and its Structural Interpretation, Ailing Huang，Tun Lu，Food Science and Biotechnology，20（6），1699-1704（2011）

　　2. 毒素DON单链抗体的同源建模及与DON结合的分子模拟研究, 郑蓉 吕暾，化学学报，69（23），2882-2888（2011）
　　3.A Comparative Reverse Docking Strategy to Identify Potential Antineoplastic Targets of Tea Funtional Components and Binding Mode, R.Zhen，T.S.Chen，Tun Lu，International Journal of Molecular Science ，12, 5200-5212（2011） 4. 一种采用新的相似性度量方法的共调控基因动态模糊聚类算法, 李小梅，郭红，吕暾 福大学报, vol39, 2, 198，（2011）
　　5. LU分解和Laplace算法在GPU上的实现, 林江宏，林锦贤，吕暾 计算机应用，v31,3,851，（2011）
　　6. 多核CPU和GPU加速分子动力学模拟的实现， 陈颖，林锦贤，吕暾 计算机应用，v31,3,843，（2011）
　　7. Classical Trajectory Studies of the D + H2 → HD + H Reaction Confined in Carbon Nanotubes: Effects of Collisions with the Nanotube Walls Tun Lu, et al., J. Phys. Chem. C ，114(19),9030-9040 （2010）
　　8. 一株产纤维素酶细菌的筛选，鉴定及产酶条件的优化 吕静琳，黄爱玲，郑蓉，李典典，吕暾 生物技术，2009,19(6)
　　9. Classical trajectory studies of the D+H2->DH+H confined in carbon nanotubes: parallel trajectories Lu Tun, et al., J. Phys.Chem. C 2008, 112, 15260-15266 (IF 4.1)
　　10. Analysis of the Mechanism by which Melatonin Inhibits Human Eosinophil Peroxidase. Lu, Tun, et al., British Journal of Pharmacology 2008, 154(6),1308-1317 　　11. Chemical reactivity within carbon nanotubes: a qantum mechanical study of the D+H2->DH+H reaction Lu, Tun, et al., J. Phys. Chem. C 2008, 112. 2654-2659 (IF 4.1) 　　12. 有关阿尔茨海默病抗Aβ蛋白的药物研究进展 林旭 黄爱玲 洪安辉 吕暾, 海峡药学, 2008, 20(10), 1
　　13. Quantum States of Hydrogen and Its Isotopes Confined in Single-Walled Carbon Nanotubes. Lu, Tun, et al., J. Phys. Chem. B 2006, 110. 1742-1751 (IF 4.1) 　　14. Recent applications of iterative methods Goldfield, E. M.; He, Y.; Lu, T., et al., Abstracts of Papers, 225th ACS National Meeting 　　15. Aquifex aeolicus Aspartate Transcarbamoylase, an Enzyme Specialized for the Efficient Utilization of Unstable Carbamoyl Phosphate at Elevated Temperature Purcarea, C., Ahuja, A., Lu, T., et. al. J. Bio. Chem. 2003, 278, 52924
　　16. Quantum States of Molecular Hydrogen and Its Isotopes in Single Walled Carbon Nanotube. Lu, Tun, et all, J. Phys. Chem. B 2003,107. 12989-12995 (IF 4.1)
　　17. The Equilibrium Constants for Molecular Hydrogen Adsorption in Carbon Nanotubes. Lu, Tun, et al. J. Theo. Comp. Chem. 2003, Vol. 2. No. 4 621-625 (IF 1.0)
　　18. Modeling rice rgMT as a plant metallothionein-like protein by the distance geometry and homology methods Lu, Tun, et al. Acta Botanica Sinica 2003, 45, 1297 (IF 0.4)
　　19. Modeling the cysteine rich domain of plant metallothionein-like protein. He,H.; Zhu,C., Lu,T., et al. Acta Botanica Sinica 2002, 44(10): 1155-1159
　　20. Prediction for tertiary structure of metallothionein CAP3 from Colletotrichum gloeosporioides He, H.; Lu, Tun; et al. Shengwu Huaxue Yu Shengwu Wuli Jinzhan 2002, 29, 293
　　21. Hiv Protease Multidrug Resistance is Associated with the Loss of Key Contacts between the Protease and the Inhibitor. Kovari, L. C.; Cheng, P; Lu, T. Sitges, Spain 2000.
　　22. Classification and Nomenclature of Plant Metallothioein-like Proteins Based on Their Cysteine Arrangement Patterns Liu, J. Y., Lu, T. Acta Botanica Sinica. 2000, 42(6): 649-652.
　　23. 3D model for Kiwi503 by Distance Geometry and Homology Method. Zhu, C., Lu, T., et al. Chinese Science Bulletin, 2000, V45(6): 602-606.
　　24. Characterization of primary structure of rice ricMT, J. Tsinghua Univ. Lu, Tun, Liu, J. Y., 2000　Vol.40　No.6　P.29-32
　　25. Analysis of salicylic acid induced proteins in rice Shi, S., Pan, M., Lu, T., et al. Tsinghua Sci. and Tech. 1999, 4, 1519